Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PGLYRP2Q96PD5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PGLYRP2Q96PD5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PGLYRP2Q96PD5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PGLYRP2Q96PD5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PGLYRP2Q96PD5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PGLYRP2Q96PD5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PGLYRP2Q96PD5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PGLYRP2Q96PD5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PGLYRP2Q96PD5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PGLYRP2Q96PD5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PGLYRP2Q96PD5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PGLYRP2Q96PD5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PGLYRP2Q96PD5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PGLYRP2Q96PD5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PGLYRP2Q96PD5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PGLYRP2Q96PD5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PGLYRP2Q96PD5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PGLYRP2Q96PD5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PGLYRP2Q96PD5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PGLYRP2Q96PD5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PGLYRP2Q96PD5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PGLYRP2Q96PD5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PGLYRP2Q96PD5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PGLYRP2Q96PD5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PGLYRP2Q96PD5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PGLYRP2Q96PD5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PGLYRP2Q96PD5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PGLYRP2Q96PD5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PGLYRP2Q96PD5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PGLYRP2Q96PD5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PGLYRP2Q96PD5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PGLYRP2Q96PD5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PGLYRP2Q96PD5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PGLYRP2Q96PD5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PGLYRP2Q96PD5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PGLYRP2Q96PD5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PGLYRP2Q96PD5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PGLYRP2Q96PD5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PGLYRP2Q96PD5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PGLYRP2Q96PD5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PGLYRP2Q96PD5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PGLYRP2Q96PD5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PGLYRP2Q96PD5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PGLYRP2Q96PD5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PGLYRP2Q96PD5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PGLYRP2Q96PD5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PGLYRP2Q96PD5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGLYRP2Q96PD5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PGLYRP2Q96PD5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PGLYRP2Q96PD5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PGLYRP2Q96PD5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PGLYRP2Q96PD5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PGLYRP2Q96PD5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PGLYRP2Q96PD5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PGLYRP2Q96PD5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGLYRP2Q96PD5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGLYRP2Q96PD5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGLYRP2Q96PD5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGLYRP2Q96PD5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PGLYRP2Q96PD5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PGLYRP2Q96PD5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PGLYRP2Q96PD5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms