Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFXN2Q96NB2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFXN2Q96NB2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFXN2Q96NB2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFXN2Q96NB2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFXN2Q96NB2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFXN2Q96NB2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFXN2Q96NB2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFXN2Q96NB2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFXN2Q96NB2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFXN2Q96NB2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFXN2Q96NB2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFXN2Q96NB2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFXN2Q96NB2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFXN2Q96NB2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SFXN2Q96NB2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFXN2Q96NB2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SFXN2Q96NB2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SFXN2Q96NB2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFXN2Q96NB2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFXN2Q96NB2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFXN2Q96NB2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SFXN2Q96NB2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFXN2Q96NB2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFXN2Q96NB2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFXN2Q96NB2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFXN2Q96NB2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFXN2Q96NB2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFXN2Q96NB2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFXN2Q96NB2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFXN2Q96NB2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFXN2Q96NB2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFXN2Q96NB2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFXN2Q96NB2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFXN2Q96NB2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFXN2Q96NB2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SFXN2Q96NB2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFXN2Q96NB2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFXN2Q96NB2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFXN2Q96NB2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFXN2Q96NB2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFXN2Q96NB2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFXN2Q96NB2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SFXN2Q96NB2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFXN2Q96NB2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFXN2Q96NB2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SFXN2Q96NB2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms