Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF488Q96MN9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF488Q96MN9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF488Q96MN9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF488Q96MN9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF488Q96MN9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF488Q96MN9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF488Q96MN9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF488Q96MN9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF488Q96MN9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF488Q96MN9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF488Q96MN9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF488Q96MN9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF488Q96MN9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF488Q96MN9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF488Q96MN9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF488Q96MN9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF488Q96MN9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF488Q96MN9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF488Q96MN9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF488Q96MN9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF488Q96MN9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF488Q96MN9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF488Q96MN9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF488Q96MN9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF488Q96MN9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF488Q96MN9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF488Q96MN9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF488Q96MN9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF488Q96MN9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms