Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSMCE3Q96MG7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NSMCE3Q96MG7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NSMCE3Q96MG7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSMCE3Q96MG7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSMCE3Q96MG7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSMCE3Q96MG7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSMCE3Q96MG7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSMCE3Q96MG7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSMCE3Q96MG7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSMCE3Q96MG7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSMCE3Q96MG7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSMCE3Q96MG7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSMCE3Q96MG7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSMCE3Q96MG7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSMCE3Q96MG7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSMCE3Q96MG7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSMCE3Q96MG7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NSMCE3Q96MG7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSMCE3Q96MG7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSMCE3Q96MG7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSMCE3Q96MG7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSMCE3Q96MG7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSMCE3Q96MG7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSMCE3Q96MG7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSMCE3Q96MG7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
NSMCE3Q96MG7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSMCE3Q96MG7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSMCE3Q96MG7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSMCE3Q96MG7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSMCE3Q96MG7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSMCE3Q96MG7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSMCE3Q96MG7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSMCE3Q96MG7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSMCE3Q96MG7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSMCE3Q96MG7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSMCE3Q96MG7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSMCE3Q96MG7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSMCE3Q96MG7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSMCE3Q96MG7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSMCE3Q96MG7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSMCE3Q96MG7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSMCE3Q96MG7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSMCE3Q96MG7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSMCE3Q96MG7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSMCE3Q96MG7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSMCE3Q96MG7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSMCE3Q96MG7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSMCE3Q96MG7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSMCE3Q96MG7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSMCE3Q96MG7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSMCE3Q96MG7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSMCE3Q96MG7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSMCE3Q96MG7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSMCE3Q96MG7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSMCE3Q96MG7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NSMCE3Q96MG7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSMCE3Q96MG7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSMCE3Q96MG7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSMCE3Q96MG7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSMCE3Q96MG7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSMCE3Q96MG7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSMCE3Q96MG7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSMCE3Q96MG7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSMCE3Q96MG7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSMCE3Q96MG7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSMCE3Q96MG7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSMCE3Q96MG7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSMCE3Q96MG7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSMCE3Q96MG7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSMCE3Q96MG7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSMCE3Q96MG7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms