Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC74BQ96LY2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC74BQ96LY2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC74BQ96LY2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC74BQ96LY2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC74BQ96LY2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC74BQ96LY2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC74BQ96LY2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC74BQ96LY2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC74BQ96LY2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC74BQ96LY2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC74BQ96LY2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC74BQ96LY2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC74BQ96LY2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC74BQ96LY2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC74BQ96LY2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC74BQ96LY2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC74BQ96LY2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC74BQ96LY2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC74BQ96LY2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC74BQ96LY2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC74BQ96LY2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC74BQ96LY2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC74BQ96LY2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC74BQ96LY2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC74BQ96LY2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC74BQ96LY2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC74BQ96LY2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC74BQ96LY2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC74BQ96LY2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC74BQ96LY2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC74BQ96LY2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC74BQ96LY2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC74BQ96LY2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC74BQ96LY2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC74BQ96LY2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC74BQ96LY2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC74BQ96LY2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC74BQ96LY2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC74BQ96LY2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC74BQ96LY2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC74BQ96LY2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC74BQ96LY2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC74BQ96LY2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC74BQ96LY2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC74BQ96LY2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC74BQ96LY2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC74BQ96LY2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC74BQ96LY2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC74BQ96LY2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC74BQ96LY2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC74BQ96LY2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC74BQ96LY2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC74BQ96LY2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC74BQ96LY2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC74BQ96LY2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC74BQ96LY2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC74BQ96LY2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC74BQ96LY2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC74BQ96LY2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC74BQ96LY2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC74BQ96LY2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms