Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR1

ZFR, Zinc finger RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFRQ96KR1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZFRQ96KR1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZFRQ96KR1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ZFRQ96KR1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZFRQ96KR1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZFRQ96KR1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZFRQ96KR1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZFRQ96KR1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZFRQ96KR1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZFRQ96KR1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZFRQ96KR1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZFRQ96KR1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZFRQ96KR1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZFRQ96KR1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZFRQ96KR1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZFRQ96KR1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZFRQ96KR1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZFRQ96KR1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZFRQ96KR1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZFRQ96KR1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZFRQ96KR1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZFRQ96KR1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZFRQ96KR1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ZFRQ96KR1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZFRQ96KR1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZFRQ96KR1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZFRQ96KR1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZFRQ96KR1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms