Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF0

MTMR8, Myotubularin-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR8Q96EF0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MTMR8Q96EF0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTMR8Q96EF0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTMR8Q96EF0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTMR8Q96EF0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTMR8Q96EF0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTMR8Q96EF0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MTMR8Q96EF0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTMR8Q96EF0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTMR8Q96EF0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTMR8Q96EF0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTMR8Q96EF0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MTMR8Q96EF0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MTMR8Q96EF0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MTMR8Q96EF0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MTMR8Q96EF0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MTMR8Q96EF0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MTMR8Q96EF0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MTMR8Q96EF0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MTMR8Q96EF0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MTMR8Q96EF0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms