Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF0

MTMR8, Myotubularin-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR8Q96EF0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MTMR8Q96EF0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTMR8Q96EF0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTMR8Q96EF0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTMR8Q96EF0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTMR8Q96EF0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTMR8Q96EF0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MTMR8Q96EF0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTMR8Q96EF0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTMR8Q96EF0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTMR8Q96EF0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTMR8Q96EF0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTMR8Q96EF0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
MTMR8Q96EF0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTMR8Q96EF0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MTMR8Q96EF0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MTMR8Q96EF0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MTMR8Q96EF0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MTMR8Q96EF0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MTMR8Q96EF0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MTMR8Q96EF0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MTMR8Q96EF0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MTMR8Q96EF0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MTMR8Q96EF0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms