Protein–RNA interactions for Protein: Q96E52

OMA1, Metalloendopeptidase OMA1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OMA1Q96E52 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OMA1Q96E52 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OMA1Q96E52 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OMA1Q96E52 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OMA1Q96E52 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OMA1Q96E52 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OMA1Q96E52 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
OMA1Q96E52 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OMA1Q96E52 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OMA1Q96E52 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OMA1Q96E52 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OMA1Q96E52 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OMA1Q96E52 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OMA1Q96E52 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OMA1Q96E52 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OMA1Q96E52 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OMA1Q96E52 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OMA1Q96E52 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OMA1Q96E52 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OMA1Q96E52 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OMA1Q96E52 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OMA1Q96E52 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OMA1Q96E52 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OMA1Q96E52 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OMA1Q96E52 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OMA1Q96E52 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OMA1Q96E52 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OMA1Q96E52 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OMA1Q96E52 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OMA1Q96E52 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OMA1Q96E52 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OMA1Q96E52 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OMA1Q96E52 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OMA1Q96E52 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OMA1Q96E52 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OMA1Q96E52 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OMA1Q96E52 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OMA1Q96E52 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OMA1Q96E52 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
OMA1Q96E52 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OMA1Q96E52 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
OMA1Q96E52 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OMA1Q96E52 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
OMA1Q96E52 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
OMA1Q96E52 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
OMA1Q96E52 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OMA1Q96E52 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
OMA1Q96E52 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OMA1Q96E52 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OMA1Q96E52 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OMA1Q96E52 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
OMA1Q96E52 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OMA1Q96E52 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OMA1Q96E52 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OMA1Q96E52 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OMA1Q96E52 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OMA1Q96E52 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OMA1Q96E52 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OMA1Q96E52 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OMA1Q96E52 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OMA1Q96E52 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OMA1Q96E52 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OMA1Q96E52 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OMA1Q96E52 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms