Protein–RNA interactions for Protein: Q96DS6

MS4A6E, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6E, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6EQ96DS6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A6EQ96DS6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A6EQ96DS6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A6EQ96DS6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A6EQ96DS6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A6EQ96DS6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A6EQ96DS6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A6EQ96DS6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A6EQ96DS6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A6EQ96DS6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A6EQ96DS6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A6EQ96DS6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A6EQ96DS6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A6EQ96DS6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MS4A6EQ96DS6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A6EQ96DS6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MS4A6EQ96DS6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A6EQ96DS6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A6EQ96DS6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A6EQ96DS6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A6EQ96DS6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A6EQ96DS6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A6EQ96DS6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A6EQ96DS6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A6EQ96DS6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A6EQ96DS6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A6EQ96DS6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A6EQ96DS6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A6EQ96DS6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A6EQ96DS6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A6EQ96DS6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A6EQ96DS6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A6EQ96DS6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A6EQ96DS6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A6EQ96DS6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A6EQ96DS6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A6EQ96DS6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A6EQ96DS6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A6EQ96DS6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A6EQ96DS6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A6EQ96DS6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A6EQ96DS6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms