Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG2BQ96BY7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG2BQ96BY7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG2BQ96BY7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG2BQ96BY7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG2BQ96BY7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG2BQ96BY7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG2BQ96BY7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG2BQ96BY7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG2BQ96BY7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG2BQ96BY7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG2BQ96BY7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG2BQ96BY7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG2BQ96BY7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG2BQ96BY7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG2BQ96BY7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG2BQ96BY7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG2BQ96BY7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG2BQ96BY7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATG2BQ96BY7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG2BQ96BY7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG2BQ96BY7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG2BQ96BY7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG2BQ96BY7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG2BQ96BY7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG2BQ96BY7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG2BQ96BY7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG2BQ96BY7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG2BQ96BY7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG2BQ96BY7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG2BQ96BY7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG2BQ96BY7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG2BQ96BY7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG2BQ96BY7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG2BQ96BY7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG2BQ96BY7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG2BQ96BY7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG2BQ96BY7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG2BQ96BY7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG2BQ96BY7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG2BQ96BY7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG2BQ96BY7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG2BQ96BY7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG2BQ96BY7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG2BQ96BY7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG2BQ96BY7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG2BQ96BY7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG2BQ96BY7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG2BQ96BY7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG2BQ96BY7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG2BQ96BY7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG2BQ96BY7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG2BQ96BY7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG2BQ96BY7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG2BQ96BY7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG2BQ96BY7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG2BQ96BY7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG2BQ96BY7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG2BQ96BY7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG2BQ96BY7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATG2BQ96BY7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATG2BQ96BY7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATG2BQ96BY7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATG2BQ96BY7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATG2BQ96BY7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATG2BQ96BY7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATG2BQ96BY7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATG2BQ96BY7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG2BQ96BY7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG2BQ96BY7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG2BQ96BY7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG2BQ96BY7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG2BQ96BY7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG2BQ96BY7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG2BQ96BY7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG2BQ96BY7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG2BQ96BY7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG2BQ96BY7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG2BQ96BY7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG2BQ96BY7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG2BQ96BY7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG2BQ96BY7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG2BQ96BY7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG2BQ96BY7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG2BQ96BY7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG2BQ96BY7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATG2BQ96BY7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG2BQ96BY7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG2BQ96BY7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG2BQ96BY7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG2BQ96BY7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG2BQ96BY7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG2BQ96BY7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG2BQ96BY7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG2BQ96BY7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG2BQ96BY7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG2BQ96BY7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG2BQ96BY7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG2BQ96BY7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG2BQ96BY7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms