Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y0

NXPE3, NXPE family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE3Q969Y0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NXPE3Q969Y0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NXPE3Q969Y0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NXPE3Q969Y0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NXPE3Q969Y0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NXPE3Q969Y0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NXPE3Q969Y0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NXPE3Q969Y0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NXPE3Q969Y0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NXPE3Q969Y0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NXPE3Q969Y0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NXPE3Q969Y0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NXPE3Q969Y0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NXPE3Q969Y0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NXPE3Q969Y0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NXPE3Q969Y0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NXPE3Q969Y0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NXPE3Q969Y0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NXPE3Q969Y0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NXPE3Q969Y0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NXPE3Q969Y0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NXPE3Q969Y0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NXPE3Q969Y0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NXPE3Q969Y0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NXPE3Q969Y0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NXPE3Q969Y0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NXPE3Q969Y0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NXPE3Q969Y0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NXPE3Q969Y0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NXPE3Q969Y0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NXPE3Q969Y0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NXPE3Q969Y0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NXPE3Q969Y0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NXPE3Q969Y0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NXPE3Q969Y0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NXPE3Q969Y0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NXPE3Q969Y0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NXPE3Q969Y0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NXPE3Q969Y0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NXPE3Q969Y0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NXPE3Q969Y0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NXPE3Q969Y0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NXPE3Q969Y0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NXPE3Q969Y0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NXPE3Q969Y0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NXPE3Q969Y0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NXPE3Q969Y0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NXPE3Q969Y0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NXPE3Q969Y0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NXPE3Q969Y0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NXPE3Q969Y0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NXPE3Q969Y0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NXPE3Q969Y0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NXPE3Q969Y0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NXPE3Q969Y0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NXPE3Q969Y0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NXPE3Q969Y0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NXPE3Q969Y0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NXPE3Q969Y0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NXPE3Q969Y0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NXPE3Q969Y0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NXPE3Q969Y0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NXPE3Q969Y0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NXPE3Q969Y0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NXPE3Q969Y0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms