Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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TRIM63Q969Q1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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