Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP1MTQ969P6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP1MTQ969P6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TOP1MTQ969P6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP1MTQ969P6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP1MTQ969P6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP1MTQ969P6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP1MTQ969P6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP1MTQ969P6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOP1MTQ969P6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOP1MTQ969P6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP1MTQ969P6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP1MTQ969P6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP1MTQ969P6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP1MTQ969P6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP1MTQ969P6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP1MTQ969P6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP1MTQ969P6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP1MTQ969P6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP1MTQ969P6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP1MTQ969P6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP1MTQ969P6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP1MTQ969P6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP1MTQ969P6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP1MTQ969P6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TOP1MTQ969P6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TOP1MTQ969P6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOP1MTQ969P6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP1MTQ969P6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP1MTQ969P6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP1MTQ969P6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP1MTQ969P6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP1MTQ969P6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP1MTQ969P6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP1MTQ969P6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP1MTQ969P6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP1MTQ969P6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP1MTQ969P6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP1MTQ969P6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP1MTQ969P6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP1MTQ969P6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP1MTQ969P6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP1MTQ969P6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP1MTQ969P6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP1MTQ969P6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP1MTQ969P6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOP1MTQ969P6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOP1MTQ969P6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOP1MTQ969P6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOP1MTQ969P6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOP1MTQ969P6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TOP1MTQ969P6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TOP1MTQ969P6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOP1MTQ969P6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOP1MTQ969P6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOP1MTQ969P6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOP1MTQ969P6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOP1MTQ969P6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOP1MTQ969P6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP1MTQ969P6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP1MTQ969P6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP1MTQ969P6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP1MTQ969P6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP1MTQ969P6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOP1MTQ969P6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOP1MTQ969P6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOP1MTQ969P6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOP1MTQ969P6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOP1MTQ969P6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOP1MTQ969P6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOP1MTQ969P6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOP1MTQ969P6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOP1MTQ969P6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOP1MTQ969P6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOP1MTQ969P6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOP1MTQ969P6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOP1MTQ969P6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOP1MTQ969P6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TOP1MTQ969P6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOP1MTQ969P6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOP1MTQ969P6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TOP1MTQ969P6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOP1MTQ969P6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOP1MTQ969P6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOP1MTQ969P6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOP1MTQ969P6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TOP1MTQ969P6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TOP1MTQ969P6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOP1MTQ969P6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOP1MTQ969P6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOP1MTQ969P6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TOP1MTQ969P6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOP1MTQ969P6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP1MTQ969P6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP1MTQ969P6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOP1MTQ969P6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOP1MTQ969P6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOP1MTQ969P6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TOP1MTQ969P6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP1MTQ969P6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms