Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HLA-CQ95604 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HLA-CQ95604 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HLA-CQ95604 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HLA-CQ95604 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HLA-CQ95604 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HLA-CQ95604 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HLA-CQ95604 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HLA-CQ95604 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HLA-CQ95604 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HLA-CQ95604 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HLA-CQ95604 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HLA-CQ95604 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HLA-CQ95604 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HLA-CQ95604 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HLA-CQ95604 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HLA-CQ95604 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HLA-CQ95604 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HLA-CQ95604 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HLA-CQ95604 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HLA-CQ95604 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HLA-CQ95604 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HLA-CQ95604 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HLA-CQ95604 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HLA-CQ95604 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HLA-CQ95604 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HLA-CQ95604 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HLA-CQ95604 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HLA-CQ95604 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HLA-CQ95604 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HLA-CQ95604 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HLA-CQ95604 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HLA-CQ95604 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HLA-CQ95604 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HLA-CQ95604 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HLA-CQ95604 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HLA-CQ95604 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HLA-CQ95604 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HLA-CQ95604 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HLA-CQ95604 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HLA-CQ95604 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HLA-CQ95604 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HLA-CQ95604 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HLA-CQ95604 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HLA-CQ95604 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HLA-CQ95604 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HLA-CQ95604 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HLA-CQ95604 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HLA-CQ95604 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HLA-CQ95604 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HLA-CQ95604 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HLA-CQ95604 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HLA-CQ95604 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HLA-CQ95604 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HLA-CQ95604 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HLA-CQ95604 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HLA-CQ95604 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HLA-CQ95604 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HLA-CQ95604 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HLA-CQ95604 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HLA-CQ95604 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HLA-CQ95604 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HLA-CQ95604 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HLA-CQ95604 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HLA-CQ95604 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HLA-CQ95604 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HLA-CQ95604 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HLA-CQ95604 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HLA-CQ95604 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HLA-CQ95604 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HLA-CQ95604 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HLA-CQ95604 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HLA-CQ95604 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HLA-CQ95604 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HLA-CQ95604 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HLA-CQ95604 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HLA-CQ95604 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HLA-CQ95604 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HLA-CQ95604 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HLA-CQ95604 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HLA-CQ95604 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HLA-CQ95604 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HLA-CQ95604 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HLA-CQ95604 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HLA-CQ95604 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms