Protein–RNA interactions for Protein: Q92903

CDS1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDS1Q92903 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDS1Q92903 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDS1Q92903 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDS1Q92903 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDS1Q92903 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDS1Q92903 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDS1Q92903 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDS1Q92903 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDS1Q92903 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDS1Q92903 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDS1Q92903 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDS1Q92903 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDS1Q92903 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDS1Q92903 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDS1Q92903 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDS1Q92903 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDS1Q92903 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDS1Q92903 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDS1Q92903 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDS1Q92903 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDS1Q92903 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDS1Q92903 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDS1Q92903 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDS1Q92903 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDS1Q92903 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDS1Q92903 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDS1Q92903 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDS1Q92903 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDS1Q92903 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDS1Q92903 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDS1Q92903 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDS1Q92903 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDS1Q92903 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDS1Q92903 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDS1Q92903 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDS1Q92903 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDS1Q92903 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDS1Q92903 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDS1Q92903 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDS1Q92903 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDS1Q92903 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDS1Q92903 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDS1Q92903 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDS1Q92903 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDS1Q92903 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDS1Q92903 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDS1Q92903 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDS1Q92903 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDS1Q92903 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDS1Q92903 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDS1Q92903 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDS1Q92903 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDS1Q92903 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDS1Q92903 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDS1Q92903 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDS1Q92903 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDS1Q92903 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDS1Q92903 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 241.4 ms