Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TNRQ92752 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TNRQ92752 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TNRQ92752 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TNRQ92752 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TNRQ92752 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
TNRQ92752 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
TNRQ92752 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
TNRQ92752 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
TNRQ92752 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TNRQ92752 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
TNRQ92752 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TNRQ92752 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TNRQ92752 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TNRQ92752 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TNRQ92752 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TNRQ92752 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
TNRQ92752 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TNRQ92752 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TNRQ92752 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TNRQ92752 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TNRQ92752 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TNRQ92752 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TNRQ92752 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TNRQ92752 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TNRQ92752 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TNRQ92752 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TNRQ92752 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TNRQ92752 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TNRQ92752 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TNRQ92752 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TNRQ92752 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TNRQ92752 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TNRQ92752 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TNRQ92752 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TNRQ92752 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TNRQ92752 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
TNRQ92752 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TNRQ92752 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TNRQ92752 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TNRQ92752 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TNRQ92752 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TNRQ92752 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TNRQ92752 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TNRQ92752 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
TNRQ92752 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TNRQ92752 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TNRQ92752 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TNRQ92752 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TNRQ92752 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TNRQ92752 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
TNRQ92752 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TNRQ92752 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
TNRQ92752 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TNRQ92752 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TNRQ92752 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TNRQ92752 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TNRQ92752 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TNRQ92752 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TNRQ92752 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TNRQ92752 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TNRQ92752 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TNRQ92752 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
TNRQ92752 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TNRQ92752 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
TNRQ92752 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TNRQ92752 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TNRQ92752 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TNRQ92752 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TNRQ92752 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
TNRQ92752 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.36
TNRQ92752 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
TNRQ92752 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
TNRQ92752 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
TNRQ92752 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TNRQ92752 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TNRQ92752 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TNRQ92752 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TNRQ92752 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TNRQ92752 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TNRQ92752 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TNRQ92752 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TNRQ92752 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TNRQ92752 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
TNRQ92752 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TNRQ92752 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TNRQ92752 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TNRQ92752 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TNRQ92752 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TNRQ92752 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
TNRQ92752 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TNRQ92752 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TNRQ92752 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TNRQ92752 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TNRQ92752 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TNRQ92752 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
TNRQ92752 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
TNRQ92752 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TNRQ92752 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TNRQ92752 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms