Protein–RNA interactions for Protein: Q92618

ZNF516, Zinc finger protein 516, humanhuman

Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF516Q92618 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF516Q92618 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF516Q92618 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF516Q92618 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF516Q92618 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF516Q92618 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF516Q92618 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF516Q92618 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF516Q92618 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF516Q92618 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF516Q92618 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF516Q92618 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF516Q92618 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF516Q92618 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF516Q92618 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF516Q92618 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF516Q92618 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF516Q92618 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF516Q92618 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF516Q92618 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF516Q92618 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF516Q92618 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF516Q92618 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF516Q92618 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF516Q92618 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF516Q92618 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF516Q92618 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF516Q92618 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF516Q92618 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF516Q92618 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF516Q92618 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF516Q92618 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF516Q92618 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF516Q92618 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF516Q92618 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF516Q92618 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF516Q92618 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF516Q92618 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF516Q92618 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF516Q92618 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF516Q92618 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF516Q92618 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF516Q92618 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF516Q92618 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF516Q92618 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF516Q92618 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF516Q92618 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF516Q92618 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF516Q92618 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF516Q92618 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF516Q92618 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF516Q92618 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF516Q92618 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF516Q92618 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF516Q92618 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF516Q92618 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF516Q92618 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF516Q92618 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF516Q92618 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF516Q92618 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF516Q92618 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF516Q92618 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF516Q92618 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF516Q92618 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF516Q92618 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF516Q92618 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF516Q92618 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF516Q92618 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF516Q92618 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF516Q92618 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF516Q92618 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF516Q92618 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF516Q92618 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF516Q92618 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF516Q92618 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF516Q92618 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF516Q92618 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF516Q92618 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF516Q92618 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF516Q92618 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF516Q92618 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF516Q92618 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF516Q92618 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF516Q92618 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF516Q92618 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF516Q92618 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF516Q92618 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF516Q92618 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF516Q92618 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF516Q92618 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF516Q92618 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF516Q92618 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF516Q92618 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF516Q92618 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF516Q92618 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF516Q92618 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF516Q92618 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF516Q92618 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF516Q92618 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF516Q92618 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms