Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX33Q8WV41 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX33Q8WV41 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX33Q8WV41 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX33Q8WV41 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX33Q8WV41 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX33Q8WV41 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX33Q8WV41 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX33Q8WV41 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX33Q8WV41 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX33Q8WV41 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX33Q8WV41 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX33Q8WV41 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX33Q8WV41 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX33Q8WV41 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX33Q8WV41 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX33Q8WV41 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX33Q8WV41 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX33Q8WV41 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX33Q8WV41 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX33Q8WV41 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX33Q8WV41 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX33Q8WV41 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX33Q8WV41 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX33Q8WV41 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX33Q8WV41 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX33Q8WV41 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX33Q8WV41 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX33Q8WV41 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX33Q8WV41 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX33Q8WV41 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX33Q8WV41 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX33Q8WV41 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX33Q8WV41 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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SNX33Q8WV41 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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SNX33Q8WV41 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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SNX33Q8WV41 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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SNX33Q8WV41 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX33Q8WV41 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX33Q8WV41 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX33Q8WV41 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX33Q8WV41 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX33Q8WV41 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX33Q8WV41 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX33Q8WV41 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX33Q8WV41 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX33Q8WV41 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX33Q8WV41 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX33Q8WV41 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX33Q8WV41 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX33Q8WV41 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX33Q8WV41 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX33Q8WV41 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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