Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAT3Q8TDW7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAT3Q8TDW7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAT3Q8TDW7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAT3Q8TDW7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAT3Q8TDW7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAT3Q8TDW7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAT3Q8TDW7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAT3Q8TDW7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAT3Q8TDW7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAT3Q8TDW7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAT3Q8TDW7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAT3Q8TDW7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAT3Q8TDW7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAT3Q8TDW7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAT3Q8TDW7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FAT3Q8TDW7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FAT3Q8TDW7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAT3Q8TDW7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAT3Q8TDW7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAT3Q8TDW7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAT3Q8TDW7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAT3Q8TDW7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAT3Q8TDW7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAT3Q8TDW7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAT3Q8TDW7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAT3Q8TDW7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAT3Q8TDW7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAT3Q8TDW7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAT3Q8TDW7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAT3Q8TDW7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAT3Q8TDW7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAT3Q8TDW7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAT3Q8TDW7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAT3Q8TDW7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FAT3Q8TDW7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAT3Q8TDW7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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