Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MYRIPQ8NFW9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MYRIPQ8NFW9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYRIPQ8NFW9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYRIPQ8NFW9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYRIPQ8NFW9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYRIPQ8NFW9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYRIPQ8NFW9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYRIPQ8NFW9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYRIPQ8NFW9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYRIPQ8NFW9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYRIPQ8NFW9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYRIPQ8NFW9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYRIPQ8NFW9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYRIPQ8NFW9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYRIPQ8NFW9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYRIPQ8NFW9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MYRIPQ8NFW9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MYRIPQ8NFW9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MYRIPQ8NFW9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MYRIPQ8NFW9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MYRIPQ8NFW9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MYRIPQ8NFW9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MYRIPQ8NFW9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MYRIPQ8NFW9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MYRIPQ8NFW9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MYRIPQ8NFW9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYRIPQ8NFW9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYRIPQ8NFW9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYRIPQ8NFW9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYRIPQ8NFW9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYRIPQ8NFW9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYRIPQ8NFW9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYRIPQ8NFW9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYRIPQ8NFW9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYRIPQ8NFW9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYRIPQ8NFW9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYRIPQ8NFW9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MYRIPQ8NFW9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MYRIPQ8NFW9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MYRIPQ8NFW9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MYRIPQ8NFW9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MYRIPQ8NFW9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MYRIPQ8NFW9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MYRIPQ8NFW9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MYRIPQ8NFW9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MYRIPQ8NFW9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MYRIPQ8NFW9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MYRIPQ8NFW9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MYRIPQ8NFW9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MYRIPQ8NFW9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MYRIPQ8NFW9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MYRIPQ8NFW9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MYRIPQ8NFW9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYRIPQ8NFW9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYRIPQ8NFW9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYRIPQ8NFW9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYRIPQ8NFW9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MYRIPQ8NFW9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms