Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF248Q8NDW4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF248Q8NDW4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF248Q8NDW4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF248Q8NDW4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF248Q8NDW4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF248Q8NDW4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF248Q8NDW4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF248Q8NDW4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF248Q8NDW4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF248Q8NDW4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms