Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
IFNL1Q8IU54 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IFNL1Q8IU54 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IFNL1Q8IU54 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IFNL1Q8IU54 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IFNL1Q8IU54 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IFNL1Q8IU54 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IFNL1Q8IU54 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IFNL1Q8IU54 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
IFNL1Q8IU54 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IFNL1Q8IU54 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
IFNL1Q8IU54 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IFNL1Q8IU54 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IFNL1Q8IU54 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IFNL1Q8IU54 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IFNL1Q8IU54 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IFNL1Q8IU54 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IFNL1Q8IU54 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IFNL1Q8IU54 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IFNL1Q8IU54 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
IFNL1Q8IU54 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
IFNL1Q8IU54 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IFNL1Q8IU54 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IFNL1Q8IU54 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IFNL1Q8IU54 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IFNL1Q8IU54 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
IFNL1Q8IU54 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
IFNL1Q8IU54 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
IFNL1Q8IU54 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
IFNL1Q8IU54 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
IFNL1Q8IU54 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IFNL1Q8IU54 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFNL1Q8IU54 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
IFNL1Q8IU54 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
IFNL1Q8IU54 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
IFNL1Q8IU54 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
IFNL1Q8IU54 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IFNL1Q8IU54 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IFNL1Q8IU54 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IFNL1Q8IU54 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IFNL1Q8IU54 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IFNL1Q8IU54 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
IFNL1Q8IU54 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IFNL1Q8IU54 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IFNL1Q8IU54 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IFNL1Q8IU54 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IFNL1Q8IU54 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IFNL1Q8IU54 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IFNL1Q8IU54 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IFNL1Q8IU54 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IFNL1Q8IU54 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
IFNL1Q8IU54 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IFNL1Q8IU54 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IFNL1Q8IU54 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IFNL1Q8IU54 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IFNL1Q8IU54 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IFNL1Q8IU54 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IFNL1Q8IU54 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFNL1Q8IU54 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
IFNL1Q8IU54 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFNL1Q8IU54 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
IFNL1Q8IU54 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFNL1Q8IU54 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFNL1Q8IU54 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFNL1Q8IU54 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFNL1Q8IU54 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFNL1Q8IU54 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IFNL1Q8IU54 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFNL1Q8IU54 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFNL1Q8IU54 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFNL1Q8IU54 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFNL1Q8IU54 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
IFNL1Q8IU54 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFNL1Q8IU54 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFNL1Q8IU54 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFNL1Q8IU54 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFNL1Q8IU54 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFNL1Q8IU54 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFNL1Q8IU54 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFNL1Q8IU54 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFNL1Q8IU54 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
IFNL1Q8IU54 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFNL1Q8IU54 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
IFNL1Q8IU54 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
IFNL1Q8IU54 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFNL1Q8IU54 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFNL1Q8IU54 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFNL1Q8IU54 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFNL1Q8IU54 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFNL1Q8IU54 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFNL1Q8IU54 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
IFNL1Q8IU54 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFNL1Q8IU54 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFNL1Q8IU54 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFNL1Q8IU54 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFNL1Q8IU54 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
IFNL1Q8IU54 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
IFNL1Q8IU54 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFNL1Q8IU54 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFNL1Q8IU54 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
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