Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NME9Q86XW9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
NME9Q86XW9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NME9Q86XW9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NME9Q86XW9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NME9Q86XW9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NME9Q86XW9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NME9Q86XW9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NME9Q86XW9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NME9Q86XW9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NME9Q86XW9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
NME9Q86XW9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NME9Q86XW9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NME9Q86XW9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NME9Q86XW9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
NME9Q86XW9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NME9Q86XW9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
NME9Q86XW9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NME9Q86XW9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NME9Q86XW9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NME9Q86XW9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NME9Q86XW9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NME9Q86XW9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NME9Q86XW9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NME9Q86XW9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NME9Q86XW9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NME9Q86XW9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NME9Q86XW9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NME9Q86XW9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
NME9Q86XW9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NME9Q86XW9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
NME9Q86XW9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
NME9Q86XW9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NME9Q86XW9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NME9Q86XW9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NME9Q86XW9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NME9Q86XW9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NME9Q86XW9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NME9Q86XW9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NME9Q86XW9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NME9Q86XW9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NME9Q86XW9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NME9Q86XW9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
NME9Q86XW9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NME9Q86XW9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NME9Q86XW9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NME9Q86XW9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NME9Q86XW9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NME9Q86XW9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
NME9Q86XW9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NME9Q86XW9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
NME9Q86XW9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NME9Q86XW9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NME9Q86XW9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NME9Q86XW9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NME9Q86XW9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NME9Q86XW9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NME9Q86XW9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NME9Q86XW9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NME9Q86XW9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NME9Q86XW9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NME9Q86XW9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NME9Q86XW9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NME9Q86XW9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms