Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RASSF3Q86WH2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASSF3Q86WH2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASSF3Q86WH2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASSF3Q86WH2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASSF3Q86WH2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASSF3Q86WH2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASSF3Q86WH2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RASSF3Q86WH2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RASSF3Q86WH2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RASSF3Q86WH2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RASSF3Q86WH2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RASSF3Q86WH2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RASSF3Q86WH2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASSF3Q86WH2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASSF3Q86WH2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASSF3Q86WH2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASSF3Q86WH2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASSF3Q86WH2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASSF3Q86WH2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASSF3Q86WH2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASSF3Q86WH2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASSF3Q86WH2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASSF3Q86WH2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASSF3Q86WH2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASSF3Q86WH2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RASSF3Q86WH2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RASSF3Q86WH2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RASSF3Q86WH2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RASSF3Q86WH2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RASSF3Q86WH2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RASSF3Q86WH2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RASSF3Q86WH2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RASSF3Q86WH2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RASSF3Q86WH2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RASSF3Q86WH2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RASSF3Q86WH2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RASSF3Q86WH2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RASSF3Q86WH2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RASSF3Q86WH2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RASSF3Q86WH2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RASSF3Q86WH2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RASSF3Q86WH2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RASSF3Q86WH2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RASSF3Q86WH2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RASSF3Q86WH2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RASSF3Q86WH2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RASSF3Q86WH2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RASSF3Q86WH2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RASSF3Q86WH2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RASSF3Q86WH2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RASSF3Q86WH2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RASSF3Q86WH2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RASSF3Q86WH2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASSF3Q86WH2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASSF3Q86WH2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms