Protein–RNA interactions for Protein: Q86W28

NLRP8, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP8Q86W28 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP8Q86W28 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP8Q86W28 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP8Q86W28 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP8Q86W28 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP8Q86W28 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP8Q86W28 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP8Q86W28 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP8Q86W28 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP8Q86W28 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP8Q86W28 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP8Q86W28 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP8Q86W28 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP8Q86W28 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP8Q86W28 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP8Q86W28 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP8Q86W28 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP8Q86W28 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP8Q86W28 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP8Q86W28 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP8Q86W28 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP8Q86W28 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP8Q86W28 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP8Q86W28 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP8Q86W28 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP8Q86W28 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP8Q86W28 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP8Q86W28 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP8Q86W28 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP8Q86W28 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP8Q86W28 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP8Q86W28 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP8Q86W28 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP8Q86W28 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP8Q86W28 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP8Q86W28 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP8Q86W28 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP8Q86W28 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP8Q86W28 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP8Q86W28 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP8Q86W28 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP8Q86W28 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP8Q86W28 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP8Q86W28 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP8Q86W28 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP8Q86W28 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP8Q86W28 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP8Q86W28 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP8Q86W28 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP8Q86W28 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP8Q86W28 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP8Q86W28 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP8Q86W28 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP8Q86W28 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP8Q86W28 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP8Q86W28 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP8Q86W28 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLRP8Q86W28 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP8Q86W28 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP8Q86W28 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP8Q86W28 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP8Q86W28 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms