Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW1

SLC51A, Organic solute transporter subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC51AQ86UW1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLC51AQ86UW1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLC51AQ86UW1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLC51AQ86UW1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLC51AQ86UW1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
SLC51AQ86UW1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SLC51AQ86UW1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SLC51AQ86UW1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SLC51AQ86UW1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SLC51AQ86UW1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SLC51AQ86UW1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SLC51AQ86UW1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SLC51AQ86UW1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SLC51AQ86UW1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SLC51AQ86UW1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SLC51AQ86UW1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SLC51AQ86UW1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SLC51AQ86UW1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLC51AQ86UW1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLC51AQ86UW1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLC51AQ86UW1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLC51AQ86UW1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
SLC51AQ86UW1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
SLC51AQ86UW1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLC51AQ86UW1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLC51AQ86UW1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLC51AQ86UW1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLC51AQ86UW1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLC51AQ86UW1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLC51AQ86UW1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SLC51AQ86UW1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLC51AQ86UW1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLC51AQ86UW1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLC51AQ86UW1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLC51AQ86UW1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLC51AQ86UW1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLC51AQ86UW1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SLC51AQ86UW1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLC51AQ86UW1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLC51AQ86UW1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLC51AQ86UW1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLC51AQ86UW1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLC51AQ86UW1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SLC51AQ86UW1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SLC51AQ86UW1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLC51AQ86UW1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
SLC51AQ86UW1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SLC51AQ86UW1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
SLC51AQ86UW1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SLC51AQ86UW1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SLC51AQ86UW1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SLC51AQ86UW1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SLC51AQ86UW1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SLC51AQ86UW1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SLC51AQ86UW1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SLC51AQ86UW1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SLC51AQ86UW1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SLC51AQ86UW1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
SLC51AQ86UW1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SLC51AQ86UW1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SLC51AQ86UW1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SLC51AQ86UW1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SLC51AQ86UW1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SLC51AQ86UW1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SLC51AQ86UW1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SLC51AQ86UW1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SLC51AQ86UW1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SLC51AQ86UW1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SLC51AQ86UW1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SLC51AQ86UW1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SLC51AQ86UW1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SLC51AQ86UW1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SLC51AQ86UW1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SLC51AQ86UW1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SLC51AQ86UW1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SLC51AQ86UW1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SLC51AQ86UW1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SLC51AQ86UW1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms