Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7H5

TMED4, Transmembrane emp24 domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED4Q7Z7H5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED4Q7Z7H5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED4Q7Z7H5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED4Q7Z7H5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED4Q7Z7H5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED4Q7Z7H5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED4Q7Z7H5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED4Q7Z7H5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED4Q7Z7H5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED4Q7Z7H5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED4Q7Z7H5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED4Q7Z7H5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED4Q7Z7H5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED4Q7Z7H5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED4Q7Z7H5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED4Q7Z7H5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED4Q7Z7H5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED4Q7Z7H5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED4Q7Z7H5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED4Q7Z7H5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED4Q7Z7H5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED4Q7Z7H5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED4Q7Z7H5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED4Q7Z7H5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED4Q7Z7H5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED4Q7Z7H5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED4Q7Z7H5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED4Q7Z7H5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED4Q7Z7H5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMED4Q7Z7H5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMED4Q7Z7H5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMED4Q7Z7H5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMED4Q7Z7H5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMED4Q7Z7H5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMED4Q7Z7H5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMED4Q7Z7H5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED4Q7Z7H5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED4Q7Z7H5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152 ms