Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBE2Q1Q7Z7E8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
UBE2Q1Q7Z7E8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
UBE2Q1Q7Z7E8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UBE2Q1Q7Z7E8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
UBE2Q1Q7Z7E8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UBE2Q1Q7Z7E8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
UBE2Q1Q7Z7E8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
UBE2Q1Q7Z7E8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
UBE2Q1Q7Z7E8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UBE2Q1Q7Z7E8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
UBE2Q1Q7Z7E8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBE2Q1Q7Z7E8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE2Q1Q7Z7E8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE2Q1Q7Z7E8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE2Q1Q7Z7E8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBE2Q1Q7Z7E8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBE2Q1Q7Z7E8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBE2Q1Q7Z7E8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
UBE2Q1Q7Z7E8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBE2Q1Q7Z7E8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBE2Q1Q7Z7E8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBE2Q1Q7Z7E8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBE2Q1Q7Z7E8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBE2Q1Q7Z7E8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBE2Q1Q7Z7E8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBE2Q1Q7Z7E8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
UBE2Q1Q7Z7E8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBE2Q1Q7Z7E8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBE2Q1Q7Z7E8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE2Q1Q7Z7E8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE2Q1Q7Z7E8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE2Q1Q7Z7E8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE2Q1Q7Z7E8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE2Q1Q7Z7E8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE2Q1Q7Z7E8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE2Q1Q7Z7E8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE2Q1Q7Z7E8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE2Q1Q7Z7E8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE2Q1Q7Z7E8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE2Q1Q7Z7E8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE2Q1Q7Z7E8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE2Q1Q7Z7E8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE2Q1Q7Z7E8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE2Q1Q7Z7E8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE2Q1Q7Z7E8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE2Q1Q7Z7E8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE2Q1Q7Z7E8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE2Q1Q7Z7E8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE2Q1Q7Z7E8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
UBE2Q1Q7Z7E8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBE2Q1Q7Z7E8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBE2Q1Q7Z7E8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
UBE2Q1Q7Z7E8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBE2Q1Q7Z7E8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
UBE2Q1Q7Z7E8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBE2Q1Q7Z7E8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
UBE2Q1Q7Z7E8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
UBE2Q1Q7Z7E8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.54■■■□□ 2
UBE2Q1Q7Z7E8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBE2Q1Q7Z7E8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.53■■■□□ 2
UBE2Q1Q7Z7E8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBE2Q1Q7Z7E8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBE2Q1Q7Z7E8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
UBE2Q1Q7Z7E8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.52■■■□□ 2
UBE2Q1Q7Z7E8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBE2Q1Q7Z7E8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBE2Q1Q7Z7E8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBE2Q1Q7Z7E8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBE2Q1Q7Z7E8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE2Q1Q7Z7E8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE2Q1Q7Z7E8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE2Q1Q7Z7E8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE2Q1Q7Z7E8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE2Q1Q7Z7E8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE2Q1Q7Z7E8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE2Q1Q7Z7E8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE2Q1Q7Z7E8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE2Q1Q7Z7E8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE2Q1Q7Z7E8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE2Q1Q7Z7E8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE2Q1Q7Z7E8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE2Q1Q7Z7E8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE2Q1Q7Z7E8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE2Q1Q7Z7E8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE2Q1Q7Z7E8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE2Q1Q7Z7E8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE2Q1Q7Z7E8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE2Q1Q7Z7E8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE2Q1Q7Z7E8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE2Q1Q7Z7E8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE2Q1Q7Z7E8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms