Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3D4

LYSMD3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD3Q7Z3D4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LYSMD3Q7Z3D4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LYSMD3Q7Z3D4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LYSMD3Q7Z3D4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LYSMD3Q7Z3D4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LYSMD3Q7Z3D4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LYSMD3Q7Z3D4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LYSMD3Q7Z3D4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LYSMD3Q7Z3D4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LYSMD3Q7Z3D4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LYSMD3Q7Z3D4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LYSMD3Q7Z3D4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LYSMD3Q7Z3D4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LYSMD3Q7Z3D4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LYSMD3Q7Z3D4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LYSMD3Q7Z3D4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LYSMD3Q7Z3D4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LYSMD3Q7Z3D4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LYSMD3Q7Z3D4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LYSMD3Q7Z3D4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LYSMD3Q7Z3D4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LYSMD3Q7Z3D4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LYSMD3Q7Z3D4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LYSMD3Q7Z3D4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LYSMD3Q7Z3D4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LYSMD3Q7Z3D4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LYSMD3Q7Z3D4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LYSMD3Q7Z3D4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LYSMD3Q7Z3D4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LYSMD3Q7Z3D4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LYSMD3Q7Z3D4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LYSMD3Q7Z3D4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LYSMD3Q7Z3D4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LYSMD3Q7Z3D4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LYSMD3Q7Z3D4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LYSMD3Q7Z3D4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LYSMD3Q7Z3D4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LYSMD3Q7Z3D4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LYSMD3Q7Z3D4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LYSMD3Q7Z3D4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LYSMD3Q7Z3D4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LYSMD3Q7Z3D4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LYSMD3Q7Z3D4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LYSMD3Q7Z3D4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LYSMD3Q7Z3D4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LYSMD3Q7Z3D4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LYSMD3Q7Z3D4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LYSMD3Q7Z3D4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LYSMD3Q7Z3D4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LYSMD3Q7Z3D4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LYSMD3Q7Z3D4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LYSMD3Q7Z3D4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LYSMD3Q7Z3D4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LYSMD3Q7Z3D4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LYSMD3Q7Z3D4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LYSMD3Q7Z3D4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LYSMD3Q7Z3D4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LYSMD3Q7Z3D4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LYSMD3Q7Z3D4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LYSMD3Q7Z3D4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LYSMD3Q7Z3D4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LYSMD3Q7Z3D4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms