Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWB6

KCTD8, BTB/POZ domain-containing protein KCTD8, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD8Q6ZWB6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD8Q6ZWB6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD8Q6ZWB6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD8Q6ZWB6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD8Q6ZWB6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD8Q6ZWB6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD8Q6ZWB6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD8Q6ZWB6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD8Q6ZWB6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD8Q6ZWB6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD8Q6ZWB6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD8Q6ZWB6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD8Q6ZWB6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD8Q6ZWB6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD8Q6ZWB6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD8Q6ZWB6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD8Q6ZWB6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD8Q6ZWB6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD8Q6ZWB6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD8Q6ZWB6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD8Q6ZWB6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD8Q6ZWB6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD8Q6ZWB6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD8Q6ZWB6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD8Q6ZWB6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD8Q6ZWB6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCTD8Q6ZWB6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
KCTD8Q6ZWB6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCTD8Q6ZWB6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD8Q6ZWB6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD8Q6ZWB6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD8Q6ZWB6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD8Q6ZWB6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD8Q6ZWB6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD8Q6ZWB6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD8Q6ZWB6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD8Q6ZWB6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD8Q6ZWB6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD8Q6ZWB6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD8Q6ZWB6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD8Q6ZWB6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD8Q6ZWB6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD8Q6ZWB6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD8Q6ZWB6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD8Q6ZWB6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD8Q6ZWB6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD8Q6ZWB6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD8Q6ZWB6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD8Q6ZWB6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD8Q6ZWB6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD8Q6ZWB6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD8Q6ZWB6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD8Q6ZWB6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD8Q6ZWB6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD8Q6ZWB6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD8Q6ZWB6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD8Q6ZWB6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD8Q6ZWB6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD8Q6ZWB6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD8Q6ZWB6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms