Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP47Q6ZTR5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP47Q6ZTR5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP47Q6ZTR5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP47Q6ZTR5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP47Q6ZTR5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP47Q6ZTR5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP47Q6ZTR5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP47Q6ZTR5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP47Q6ZTR5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP47Q6ZTR5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP47Q6ZTR5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP47Q6ZTR5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP47Q6ZTR5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP47Q6ZTR5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP47Q6ZTR5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP47Q6ZTR5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP47Q6ZTR5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP47Q6ZTR5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP47Q6ZTR5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP47Q6ZTR5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP47Q6ZTR5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP47Q6ZTR5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP47Q6ZTR5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP47Q6ZTR5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP47Q6ZTR5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP47Q6ZTR5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP47Q6ZTR5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP47Q6ZTR5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP47Q6ZTR5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP47Q6ZTR5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP47Q6ZTR5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP47Q6ZTR5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP47Q6ZTR5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP47Q6ZTR5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP47Q6ZTR5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP47Q6ZTR5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP47Q6ZTR5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP47Q6ZTR5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP47Q6ZTR5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP47Q6ZTR5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP47Q6ZTR5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP47Q6ZTR5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP47Q6ZTR5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP47Q6ZTR5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP47Q6ZTR5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP47Q6ZTR5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP47Q6ZTR5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP47Q6ZTR5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP47Q6ZTR5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP47Q6ZTR5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP47Q6ZTR5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP47Q6ZTR5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP47Q6ZTR5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP47Q6ZTR5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP47Q6ZTR5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP47Q6ZTR5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP47Q6ZTR5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
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