Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM43BQ6ZT52 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM43BQ6ZT52 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM43BQ6ZT52 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM43BQ6ZT52 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM43BQ6ZT52 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM43BQ6ZT52 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM43BQ6ZT52 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM43BQ6ZT52 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM43BQ6ZT52 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM43BQ6ZT52 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM43BQ6ZT52 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM43BQ6ZT52 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM43BQ6ZT52 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM43BQ6ZT52 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM43BQ6ZT52 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM43BQ6ZT52 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM43BQ6ZT52 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM43BQ6ZT52 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM43BQ6ZT52 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM43BQ6ZT52 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM43BQ6ZT52 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM43BQ6ZT52 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM43BQ6ZT52 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM43BQ6ZT52 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM43BQ6ZT52 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM43BQ6ZT52 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM43BQ6ZT52 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM43BQ6ZT52 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM43BQ6ZT52 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM43BQ6ZT52 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM43BQ6ZT52 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM43BQ6ZT52 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM43BQ6ZT52 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM43BQ6ZT52 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM43BQ6ZT52 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FAM43BQ6ZT52 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FAM43BQ6ZT52 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FAM43BQ6ZT52 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM43BQ6ZT52 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM43BQ6ZT52 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM43BQ6ZT52 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM43BQ6ZT52 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM43BQ6ZT52 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM43BQ6ZT52 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM43BQ6ZT52 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM43BQ6ZT52 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM43BQ6ZT52 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM43BQ6ZT52 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM43BQ6ZT52 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM43BQ6ZT52 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM43BQ6ZT52 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM43BQ6ZT52 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM43BQ6ZT52 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM43BQ6ZT52 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM43BQ6ZT52 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM43BQ6ZT52 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM43BQ6ZT52 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM43BQ6ZT52 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM43BQ6ZT52 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM43BQ6ZT52 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM43BQ6ZT52 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM43BQ6ZT52 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM43BQ6ZT52 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM43BQ6ZT52 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM43BQ6ZT52 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM43BQ6ZT52 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM43BQ6ZT52 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM43BQ6ZT52 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM43BQ6ZT52 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM43BQ6ZT52 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM43BQ6ZT52 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM43BQ6ZT52 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM43BQ6ZT52 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM43BQ6ZT52 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM43BQ6ZT52 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM43BQ6ZT52 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM43BQ6ZT52 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM43BQ6ZT52 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM43BQ6ZT52 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM43BQ6ZT52 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM43BQ6ZT52 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM43BQ6ZT52 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM43BQ6ZT52 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM43BQ6ZT52 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM43BQ6ZT52 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM43BQ6ZT52 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FAM43BQ6ZT52 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FAM43BQ6ZT52 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FAM43BQ6ZT52 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FAM43BQ6ZT52 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM43BQ6ZT52 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM43BQ6ZT52 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM43BQ6ZT52 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM43BQ6ZT52 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM43BQ6ZT52 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM43BQ6ZT52 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM43BQ6ZT52 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM43BQ6ZT52 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM43BQ6ZT52 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms