Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CD109Q6YHK3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
CD109Q6YHK3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
CD109Q6YHK3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CD109Q6YHK3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CD109Q6YHK3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CD109Q6YHK3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CD109Q6YHK3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CD109Q6YHK3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
CD109Q6YHK3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
CD109Q6YHK3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CD109Q6YHK3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CD109Q6YHK3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CD109Q6YHK3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CD109Q6YHK3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CD109Q6YHK3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CD109Q6YHK3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CD109Q6YHK3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CD109Q6YHK3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CD109Q6YHK3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CD109Q6YHK3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CD109Q6YHK3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CD109Q6YHK3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CD109Q6YHK3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CD109Q6YHK3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CD109Q6YHK3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
CD109Q6YHK3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.73
CD109Q6YHK3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CD109Q6YHK3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
CD109Q6YHK3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CD109Q6YHK3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CD109Q6YHK3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CD109Q6YHK3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CD109Q6YHK3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CD109Q6YHK3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CD109Q6YHK3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CD109Q6YHK3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CD109Q6YHK3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CD109Q6YHK3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CD109Q6YHK3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CD109Q6YHK3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
CD109Q6YHK3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CD109Q6YHK3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CD109Q6YHK3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CD109Q6YHK3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CD109Q6YHK3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
CD109Q6YHK3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
CD109Q6YHK3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
CD109Q6YHK3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
CD109Q6YHK3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CD109Q6YHK3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
CD109Q6YHK3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
CD109Q6YHK3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CD109Q6YHK3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CD109Q6YHK3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CD109Q6YHK3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CD109Q6YHK3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
CD109Q6YHK3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CD109Q6YHK3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CD109Q6YHK3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CD109Q6YHK3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CD109Q6YHK3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CD109Q6YHK3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CD109Q6YHK3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
CD109Q6YHK3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CD109Q6YHK3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CD109Q6YHK3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CD109Q6YHK3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
CD109Q6YHK3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CD109Q6YHK3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CD109Q6YHK3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CD109Q6YHK3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CD109Q6YHK3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CD109Q6YHK3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CD109Q6YHK3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CD109Q6YHK3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
CD109Q6YHK3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CD109Q6YHK3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CD109Q6YHK3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CD109Q6YHK3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CD109Q6YHK3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CD109Q6YHK3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CD109Q6YHK3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CD109Q6YHK3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CD109Q6YHK3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
CD109Q6YHK3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CD109Q6YHK3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CD109Q6YHK3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CD109Q6YHK3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
CD109Q6YHK3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CD109Q6YHK3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CD109Q6YHK3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CD109Q6YHK3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
CD109Q6YHK3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
CD109Q6YHK3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
CD109Q6YHK3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
CD109Q6YHK3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CD109Q6YHK3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CD109Q6YHK3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CD109Q6YHK3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms