Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY09

CEACAM20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM20Q6UY09 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEACAM20Q6UY09 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEACAM20Q6UY09 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEACAM20Q6UY09 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEACAM20Q6UY09 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEACAM20Q6UY09 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEACAM20Q6UY09 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEACAM20Q6UY09 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEACAM20Q6UY09 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEACAM20Q6UY09 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEACAM20Q6UY09 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEACAM20Q6UY09 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEACAM20Q6UY09 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEACAM20Q6UY09 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEACAM20Q6UY09 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEACAM20Q6UY09 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEACAM20Q6UY09 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEACAM20Q6UY09 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEACAM20Q6UY09 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEACAM20Q6UY09 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms