Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWH4

FAM198B, Protein FAM198B, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM198BQ6UWH4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM198BQ6UWH4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM198BQ6UWH4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM198BQ6UWH4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM198BQ6UWH4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM198BQ6UWH4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM198BQ6UWH4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM198BQ6UWH4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM198BQ6UWH4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM198BQ6UWH4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM198BQ6UWH4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM198BQ6UWH4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM198BQ6UWH4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM198BQ6UWH4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM198BQ6UWH4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM198BQ6UWH4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM198BQ6UWH4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM198BQ6UWH4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM198BQ6UWH4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM198BQ6UWH4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM198BQ6UWH4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM198BQ6UWH4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM198BQ6UWH4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM198BQ6UWH4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM198BQ6UWH4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM198BQ6UWH4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM198BQ6UWH4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM198BQ6UWH4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM198BQ6UWH4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM198BQ6UWH4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM198BQ6UWH4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM198BQ6UWH4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM198BQ6UWH4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM198BQ6UWH4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM198BQ6UWH4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM198BQ6UWH4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM198BQ6UWH4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM198BQ6UWH4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM198BQ6UWH4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM198BQ6UWH4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM198BQ6UWH4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM198BQ6UWH4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM198BQ6UWH4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM198BQ6UWH4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM198BQ6UWH4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM198BQ6UWH4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM198BQ6UWH4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM198BQ6UWH4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM198BQ6UWH4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM198BQ6UWH4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM198BQ6UWH4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM198BQ6UWH4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM198BQ6UWH4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM198BQ6UWH4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM198BQ6UWH4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM198BQ6UWH4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM198BQ6UWH4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM198BQ6UWH4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM198BQ6UWH4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM198BQ6UWH4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM198BQ6UWH4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM198BQ6UWH4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM198BQ6UWH4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM198BQ6UWH4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms