Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAF7Q6Q0C0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAF7Q6Q0C0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAF7Q6Q0C0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAF7Q6Q0C0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAF7Q6Q0C0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAF7Q6Q0C0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAF7Q6Q0C0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAF7Q6Q0C0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAF7Q6Q0C0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAF7Q6Q0C0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAF7Q6Q0C0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAF7Q6Q0C0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAF7Q6Q0C0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAF7Q6Q0C0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAF7Q6Q0C0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAF7Q6Q0C0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAF7Q6Q0C0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAF7Q6Q0C0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAF7Q6Q0C0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAF7Q6Q0C0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAF7Q6Q0C0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAF7Q6Q0C0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAF7Q6Q0C0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAF7Q6Q0C0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAF7Q6Q0C0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAF7Q6Q0C0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAF7Q6Q0C0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAF7Q6Q0C0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAF7Q6Q0C0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAF7Q6Q0C0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAF7Q6Q0C0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAF7Q6Q0C0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAF7Q6Q0C0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAF7Q6Q0C0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAF7Q6Q0C0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TRAF7Q6Q0C0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAF7Q6Q0C0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAF7Q6Q0C0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAF7Q6Q0C0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAF7Q6Q0C0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAF7Q6Q0C0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAF7Q6Q0C0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAF7Q6Q0C0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAF7Q6Q0C0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAF7Q6Q0C0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAF7Q6Q0C0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAF7Q6Q0C0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAF7Q6Q0C0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAF7Q6Q0C0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAF7Q6Q0C0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAF7Q6Q0C0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAF7Q6Q0C0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAF7Q6Q0C0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAF7Q6Q0C0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAF7Q6Q0C0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAF7Q6Q0C0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAF7Q6Q0C0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAF7Q6Q0C0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAF7Q6Q0C0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAF7Q6Q0C0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAF7Q6Q0C0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAF7Q6Q0C0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAF7Q6Q0C0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAF7Q6Q0C0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAF7Q6Q0C0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAF7Q6Q0C0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAF7Q6Q0C0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAF7Q6Q0C0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAF7Q6Q0C0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAF7Q6Q0C0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAF7Q6Q0C0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAF7Q6Q0C0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAF7Q6Q0C0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAF7Q6Q0C0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAF7Q6Q0C0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAF7Q6Q0C0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAF7Q6Q0C0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAF7Q6Q0C0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAF7Q6Q0C0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAF7Q6Q0C0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAF7Q6Q0C0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAF7Q6Q0C0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAF7Q6Q0C0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAF7Q6Q0C0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms