Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3R8

NEK5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK5Q6P3R8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK5Q6P3R8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEK5Q6P3R8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEK5Q6P3R8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEK5Q6P3R8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEK5Q6P3R8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK5Q6P3R8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK5Q6P3R8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK5Q6P3R8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK5Q6P3R8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK5Q6P3R8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK5Q6P3R8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK5Q6P3R8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK5Q6P3R8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK5Q6P3R8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK5Q6P3R8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK5Q6P3R8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK5Q6P3R8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK5Q6P3R8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK5Q6P3R8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK5Q6P3R8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK5Q6P3R8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK5Q6P3R8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK5Q6P3R8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK5Q6P3R8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK5Q6P3R8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK5Q6P3R8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK5Q6P3R8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK5Q6P3R8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK5Q6P3R8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK5Q6P3R8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK5Q6P3R8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEK5Q6P3R8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEK5Q6P3R8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEK5Q6P3R8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEK5Q6P3R8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEK5Q6P3R8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEK5Q6P3R8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK5Q6P3R8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK5Q6P3R8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK5Q6P3R8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEK5Q6P3R8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEK5Q6P3R8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEK5Q6P3R8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEK5Q6P3R8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK5Q6P3R8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK5Q6P3R8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK5Q6P3R8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK5Q6P3R8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK5Q6P3R8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK5Q6P3R8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK5Q6P3R8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK5Q6P3R8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK5Q6P3R8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK5Q6P3R8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK5Q6P3R8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK5Q6P3R8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK5Q6P3R8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK5Q6P3R8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK5Q6P3R8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK5Q6P3R8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK5Q6P3R8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK5Q6P3R8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms