Protein–RNA interactions for Protein: Q6J4K2

SLC8B1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8B1Q6J4K2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC8B1Q6J4K2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC8B1Q6J4K2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC8B1Q6J4K2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC8B1Q6J4K2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC8B1Q6J4K2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC8B1Q6J4K2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC8B1Q6J4K2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC8B1Q6J4K2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC8B1Q6J4K2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC8B1Q6J4K2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC8B1Q6J4K2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC8B1Q6J4K2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC8B1Q6J4K2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC8B1Q6J4K2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC8B1Q6J4K2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC8B1Q6J4K2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC8B1Q6J4K2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC8B1Q6J4K2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SLC8B1Q6J4K2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC8B1Q6J4K2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC8B1Q6J4K2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC8B1Q6J4K2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC8B1Q6J4K2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC8B1Q6J4K2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC8B1Q6J4K2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC8B1Q6J4K2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC8B1Q6J4K2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC8B1Q6J4K2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC8B1Q6J4K2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC8B1Q6J4K2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC8B1Q6J4K2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC8B1Q6J4K2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC8B1Q6J4K2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC8B1Q6J4K2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC8B1Q6J4K2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC8B1Q6J4K2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC8B1Q6J4K2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC8B1Q6J4K2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC8B1Q6J4K2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC8B1Q6J4K2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC8B1Q6J4K2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC8B1Q6J4K2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC8B1Q6J4K2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC8B1Q6J4K2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC8B1Q6J4K2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC8B1Q6J4K2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC8B1Q6J4K2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC8B1Q6J4K2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC8B1Q6J4K2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC8B1Q6J4K2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC8B1Q6J4K2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC8B1Q6J4K2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC8B1Q6J4K2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC8B1Q6J4K2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC8B1Q6J4K2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC8B1Q6J4K2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC8B1Q6J4K2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC8B1Q6J4K2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC8B1Q6J4K2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC8B1Q6J4K2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC8B1Q6J4K2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC8B1Q6J4K2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC8B1Q6J4K2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC8B1Q6J4K2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC8B1Q6J4K2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC8B1Q6J4K2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC8B1Q6J4K2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC8B1Q6J4K2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC8B1Q6J4K2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC8B1Q6J4K2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC8B1Q6J4K2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC8B1Q6J4K2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC8B1Q6J4K2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC8B1Q6J4K2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC8B1Q6J4K2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC8B1Q6J4K2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC8B1Q6J4K2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC8B1Q6J4K2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC8B1Q6J4K2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC8B1Q6J4K2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC8B1Q6J4K2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC8B1Q6J4K2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC8B1Q6J4K2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC8B1Q6J4K2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC8B1Q6J4K2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC8B1Q6J4K2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC8B1Q6J4K2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC8B1Q6J4K2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC8B1Q6J4K2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC8B1Q6J4K2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC8B1Q6J4K2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC8B1Q6J4K2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC8B1Q6J4K2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC8B1Q6J4K2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC8B1Q6J4K2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC8B1Q6J4K2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC8B1Q6J4K2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC8B1Q6J4K2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC8B1Q6J4K2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 260.5 ms