Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.44■■■□□ 2.78
VIRMAQ69YN4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
VIRMAQ69YN4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
VIRMAQ69YN4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
VIRMAQ69YN4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
VIRMAQ69YN4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
VIRMAQ69YN4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
VIRMAQ69YN4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
VIRMAQ69YN4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
VIRMAQ69YN4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
VIRMAQ69YN4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
VIRMAQ69YN4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
VIRMAQ69YN4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
VIRMAQ69YN4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
VIRMAQ69YN4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
VIRMAQ69YN4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
VIRMAQ69YN4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
VIRMAQ69YN4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
VIRMAQ69YN4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
VIRMAQ69YN4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
VIRMAQ69YN4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
VIRMAQ69YN4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
VIRMAQ69YN4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
VIRMAQ69YN4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
VIRMAQ69YN4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
VIRMAQ69YN4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
VIRMAQ69YN4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
VIRMAQ69YN4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
VIRMAQ69YN4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
VIRMAQ69YN4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
VIRMAQ69YN4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
VIRMAQ69YN4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
VIRMAQ69YN4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
VIRMAQ69YN4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
VIRMAQ69YN4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
VIRMAQ69YN4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
VIRMAQ69YN4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
VIRMAQ69YN4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
VIRMAQ69YN4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
VIRMAQ69YN4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
VIRMAQ69YN4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
VIRMAQ69YN4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
VIRMAQ69YN4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
VIRMAQ69YN4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
VIRMAQ69YN4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
VIRMAQ69YN4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
VIRMAQ69YN4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
VIRMAQ69YN4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
VIRMAQ69YN4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
VIRMAQ69YN4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
VIRMAQ69YN4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
VIRMAQ69YN4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
VIRMAQ69YN4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
VIRMAQ69YN4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
VIRMAQ69YN4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
VIRMAQ69YN4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
VIRMAQ69YN4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
VIRMAQ69YN4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
VIRMAQ69YN4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
VIRMAQ69YN4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
VIRMAQ69YN4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
VIRMAQ69YN4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
VIRMAQ69YN4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
VIRMAQ69YN4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms