Protein–RNA interactions for Protein: Q66GS9

CEP135, Centrosomal protein of 135 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP135Q66GS9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP135Q66GS9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP135Q66GS9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP135Q66GS9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP135Q66GS9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP135Q66GS9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP135Q66GS9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP135Q66GS9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP135Q66GS9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP135Q66GS9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP135Q66GS9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CEP135Q66GS9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CEP135Q66GS9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CEP135Q66GS9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CEP135Q66GS9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CEP135Q66GS9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CEP135Q66GS9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CEP135Q66GS9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CEP135Q66GS9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CEP135Q66GS9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CEP135Q66GS9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CEP135Q66GS9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CEP135Q66GS9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CEP135Q66GS9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CEP135Q66GS9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP135Q66GS9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CEP135Q66GS9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CEP135Q66GS9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CEP135Q66GS9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CEP135Q66GS9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CEP135Q66GS9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CEP135Q66GS9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CEP135Q66GS9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CEP135Q66GS9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CEP135Q66GS9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CEP135Q66GS9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP135Q66GS9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP135Q66GS9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP135Q66GS9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP135Q66GS9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CEP135Q66GS9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CEP135Q66GS9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CEP135Q66GS9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CEP135Q66GS9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CEP135Q66GS9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CEP135Q66GS9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CEP135Q66GS9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CEP135Q66GS9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CEP135Q66GS9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CEP135Q66GS9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CEP135Q66GS9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP135Q66GS9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP135Q66GS9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP135Q66GS9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP135Q66GS9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP135Q66GS9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP135Q66GS9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP135Q66GS9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP135Q66GS9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP135Q66GS9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP135Q66GS9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP135Q66GS9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.1 ms