Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM5

PRAMEF9, PRAME family member 9/15, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF9Q5VWM5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF9Q5VWM5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF9Q5VWM5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF9Q5VWM5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF9Q5VWM5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF9Q5VWM5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF9Q5VWM5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF9Q5VWM5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF9Q5VWM5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF9Q5VWM5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF9Q5VWM5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF9Q5VWM5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF9Q5VWM5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF9Q5VWM5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF9Q5VWM5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF9Q5VWM5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF9Q5VWM5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRAMEF9Q5VWM5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF9Q5VWM5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF9Q5VWM5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF9Q5VWM5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF9Q5VWM5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF9Q5VWM5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF9Q5VWM5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF9Q5VWM5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF9Q5VWM5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF9Q5VWM5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF9Q5VWM5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF9Q5VWM5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF9Q5VWM5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF9Q5VWM5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF9Q5VWM5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF9Q5VWM5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF9Q5VWM5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF9Q5VWM5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF9Q5VWM5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF9Q5VWM5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF9Q5VWM5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF9Q5VWM5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF9Q5VWM5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF9Q5VWM5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF9Q5VWM5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF9Q5VWM5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRAMEF9Q5VWM5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRAMEF9Q5VWM5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF9Q5VWM5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRAMEF9Q5VWM5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRAMEF9Q5VWM5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF9Q5VWM5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF9Q5VWM5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF9Q5VWM5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF9Q5VWM5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF9Q5VWM5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF9Q5VWM5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF9Q5VWM5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms