Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRCH2Q5VUJ6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRCH2Q5VUJ6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LRCH2Q5VUJ6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRCH2Q5VUJ6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LRCH2Q5VUJ6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LRCH2Q5VUJ6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRCH2Q5VUJ6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRCH2Q5VUJ6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRCH2Q5VUJ6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LRCH2Q5VUJ6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRCH2Q5VUJ6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LRCH2Q5VUJ6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LRCH2Q5VUJ6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRCH2Q5VUJ6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRCH2Q5VUJ6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRCH2Q5VUJ6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRCH2Q5VUJ6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LRCH2Q5VUJ6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LRCH2Q5VUJ6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRCH2Q5VUJ6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms