Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf135Q5VTT2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf135Q5VTT2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf135Q5VTT2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf135Q5VTT2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf135Q5VTT2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf135Q5VTT2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf135Q5VTT2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf135Q5VTT2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf135Q5VTT2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf135Q5VTT2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf135Q5VTT2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf135Q5VTT2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf135Q5VTT2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf135Q5VTT2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf135Q5VTT2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf135Q5VTT2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf135Q5VTT2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf135Q5VTT2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf135Q5VTT2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf135Q5VTT2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf135Q5VTT2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf135Q5VTT2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf135Q5VTT2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf135Q5VTT2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf135Q5VTT2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf135Q5VTT2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf135Q5VTT2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf135Q5VTT2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf135Q5VTT2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf135Q5VTT2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf135Q5VTT2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf135Q5VTT2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf135Q5VTT2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C9orf135Q5VTT2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C9orf135Q5VTT2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf135Q5VTT2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf135Q5VTT2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms