Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CCDC18Q5T9S5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CCDC18Q5T9S5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
CCDC18Q5T9S5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CCDC18Q5T9S5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CCDC18Q5T9S5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CCDC18Q5T9S5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CCDC18Q5T9S5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CCDC18Q5T9S5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
CCDC18Q5T9S5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CCDC18Q5T9S5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CCDC18Q5T9S5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CCDC18Q5T9S5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CCDC18Q5T9S5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CCDC18Q5T9S5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CCDC18Q5T9S5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CCDC18Q5T9S5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CCDC18Q5T9S5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CCDC18Q5T9S5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
CCDC18Q5T9S5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CCDC18Q5T9S5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
CCDC18Q5T9S5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
CCDC18Q5T9S5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CCDC18Q5T9S5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CCDC18Q5T9S5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CCDC18Q5T9S5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CCDC18Q5T9S5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CCDC18Q5T9S5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CCDC18Q5T9S5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CCDC18Q5T9S5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CCDC18Q5T9S5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
CCDC18Q5T9S5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CCDC18Q5T9S5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CCDC18Q5T9S5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CCDC18Q5T9S5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CCDC18Q5T9S5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CCDC18Q5T9S5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CCDC18Q5T9S5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CCDC18Q5T9S5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
CCDC18Q5T9S5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
CCDC18Q5T9S5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CCDC18Q5T9S5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CCDC18Q5T9S5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CCDC18Q5T9S5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CCDC18Q5T9S5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CCDC18Q5T9S5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CCDC18Q5T9S5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CCDC18Q5T9S5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CCDC18Q5T9S5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CCDC18Q5T9S5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CCDC18Q5T9S5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
CCDC18Q5T9S5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CCDC18Q5T9S5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CCDC18Q5T9S5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CCDC18Q5T9S5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CCDC18Q5T9S5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CCDC18Q5T9S5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CCDC18Q5T9S5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
CCDC18Q5T9S5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
CCDC18Q5T9S5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CCDC18Q5T9S5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
CCDC18Q5T9S5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CCDC18Q5T9S5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
CCDC18Q5T9S5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CCDC18Q5T9S5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
CCDC18Q5T9S5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CCDC18Q5T9S5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CCDC18Q5T9S5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CCDC18Q5T9S5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CCDC18Q5T9S5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CCDC18Q5T9S5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CCDC18Q5T9S5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CCDC18Q5T9S5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CCDC18Q5T9S5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
CCDC18Q5T9S5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CCDC18Q5T9S5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CCDC18Q5T9S5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CCDC18Q5T9S5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CCDC18Q5T9S5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
CCDC18Q5T9S5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
CCDC18Q5T9S5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CCDC18Q5T9S5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CCDC18Q5T9S5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CCDC18Q5T9S5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CCDC18Q5T9S5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CCDC18Q5T9S5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CCDC18Q5T9S5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CCDC18Q5T9S5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CCDC18Q5T9S5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CCDC18Q5T9S5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CCDC18Q5T9S5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CCDC18Q5T9S5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CCDC18Q5T9S5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CCDC18Q5T9S5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CCDC18Q5T9S5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CCDC18Q5T9S5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CCDC18Q5T9S5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CCDC18Q5T9S5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CCDC18Q5T9S5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CCDC18Q5T9S5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms