Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGT7

RTP2, Receptor-transporting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP2Q5QGT7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RTP2Q5QGT7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RTP2Q5QGT7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTP2Q5QGT7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTP2Q5QGT7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTP2Q5QGT7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTP2Q5QGT7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTP2Q5QGT7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTP2Q5QGT7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTP2Q5QGT7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTP2Q5QGT7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTP2Q5QGT7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTP2Q5QGT7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTP2Q5QGT7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTP2Q5QGT7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTP2Q5QGT7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTP2Q5QGT7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTP2Q5QGT7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTP2Q5QGT7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTP2Q5QGT7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTP2Q5QGT7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTP2Q5QGT7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTP2Q5QGT7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTP2Q5QGT7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTP2Q5QGT7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RTP2Q5QGT7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTP2Q5QGT7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTP2Q5QGT7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTP2Q5QGT7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTP2Q5QGT7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RTP2Q5QGT7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RTP2Q5QGT7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTP2Q5QGT7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTP2Q5QGT7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTP2Q5QGT7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTP2Q5QGT7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTP2Q5QGT7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTP2Q5QGT7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTP2Q5QGT7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTP2Q5QGT7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTP2Q5QGT7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTP2Q5QGT7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTP2Q5QGT7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTP2Q5QGT7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTP2Q5QGT7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTP2Q5QGT7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTP2Q5QGT7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RTP2Q5QGT7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTP2Q5QGT7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTP2Q5QGT7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTP2Q5QGT7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTP2Q5QGT7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTP2Q5QGT7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTP2Q5QGT7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTP2Q5QGT7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTP2Q5QGT7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTP2Q5QGT7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTP2Q5QGT7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTP2Q5QGT7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RTP2Q5QGT7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTP2Q5QGT7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTP2Q5QGT7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTP2Q5QGT7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms