Protein–RNA interactions for Protein: Q5M7Z0

RNFT1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT1Q5M7Z0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNFT1Q5M7Z0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNFT1Q5M7Z0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNFT1Q5M7Z0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNFT1Q5M7Z0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNFT1Q5M7Z0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNFT1Q5M7Z0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNFT1Q5M7Z0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNFT1Q5M7Z0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNFT1Q5M7Z0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNFT1Q5M7Z0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNFT1Q5M7Z0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNFT1Q5M7Z0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNFT1Q5M7Z0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNFT1Q5M7Z0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNFT1Q5M7Z0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNFT1Q5M7Z0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNFT1Q5M7Z0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNFT1Q5M7Z0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNFT1Q5M7Z0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNFT1Q5M7Z0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNFT1Q5M7Z0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNFT1Q5M7Z0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNFT1Q5M7Z0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNFT1Q5M7Z0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNFT1Q5M7Z0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNFT1Q5M7Z0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNFT1Q5M7Z0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNFT1Q5M7Z0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNFT1Q5M7Z0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNFT1Q5M7Z0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNFT1Q5M7Z0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms