Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF542PQ5EBM4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF542PQ5EBM4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF542PQ5EBM4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF542PQ5EBM4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF542PQ5EBM4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF542PQ5EBM4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF542PQ5EBM4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF542PQ5EBM4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF542PQ5EBM4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF542PQ5EBM4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF542PQ5EBM4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF542PQ5EBM4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF542PQ5EBM4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF542PQ5EBM4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF542PQ5EBM4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF542PQ5EBM4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF542PQ5EBM4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF542PQ5EBM4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF542PQ5EBM4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF542PQ5EBM4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF542PQ5EBM4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF542PQ5EBM4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF542PQ5EBM4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF542PQ5EBM4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF542PQ5EBM4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF542PQ5EBM4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF542PQ5EBM4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF542PQ5EBM4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF542PQ5EBM4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF542PQ5EBM4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF542PQ5EBM4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF542PQ5EBM4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF542PQ5EBM4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF542PQ5EBM4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF542PQ5EBM4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF542PQ5EBM4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF542PQ5EBM4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF542PQ5EBM4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF542PQ5EBM4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF542PQ5EBM4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF542PQ5EBM4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF542PQ5EBM4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF542PQ5EBM4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF542PQ5EBM4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF542PQ5EBM4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF542PQ5EBM4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF542PQ5EBM4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF542PQ5EBM4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF542PQ5EBM4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF542PQ5EBM4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF542PQ5EBM4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF542PQ5EBM4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF542PQ5EBM4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF542PQ5EBM4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF542PQ5EBM4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF542PQ5EBM4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF542PQ5EBM4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF542PQ5EBM4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF542PQ5EBM4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF542PQ5EBM4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF542PQ5EBM4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF542PQ5EBM4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF542PQ5EBM4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF542PQ5EBM4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF542PQ5EBM4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF542PQ5EBM4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF542PQ5EBM4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF542PQ5EBM4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF542PQ5EBM4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF542PQ5EBM4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF542PQ5EBM4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF542PQ5EBM4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF542PQ5EBM4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF542PQ5EBM4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF542PQ5EBM4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF542PQ5EBM4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF542PQ5EBM4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF542PQ5EBM4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF542PQ5EBM4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF542PQ5EBM4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF542PQ5EBM4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF542PQ5EBM4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF542PQ5EBM4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF542PQ5EBM4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF542PQ5EBM4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF542PQ5EBM4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF542PQ5EBM4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF542PQ5EBM4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF542PQ5EBM4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF542PQ5EBM4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF542PQ5EBM4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF542PQ5EBM4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF542PQ5EBM4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF542PQ5EBM4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF542PQ5EBM4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF542PQ5EBM4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF542PQ5EBM4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF542PQ5EBM4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF542PQ5EBM4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms