Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DCAF6Q58WW2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DCAF6Q58WW2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DCAF6Q58WW2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DCAF6Q58WW2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCAF6Q58WW2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCAF6Q58WW2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCAF6Q58WW2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCAF6Q58WW2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCAF6Q58WW2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DCAF6Q58WW2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCAF6Q58WW2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCAF6Q58WW2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCAF6Q58WW2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
DCAF6Q58WW2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCAF6Q58WW2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCAF6Q58WW2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCAF6Q58WW2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCAF6Q58WW2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCAF6Q58WW2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCAF6Q58WW2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCAF6Q58WW2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DCAF6Q58WW2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCAF6Q58WW2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCAF6Q58WW2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCAF6Q58WW2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCAF6Q58WW2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DCAF6Q58WW2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCAF6Q58WW2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCAF6Q58WW2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCAF6Q58WW2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DCAF6Q58WW2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DCAF6Q58WW2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DCAF6Q58WW2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DCAF6Q58WW2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DCAF6Q58WW2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCAF6Q58WW2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCAF6Q58WW2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCAF6Q58WW2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCAF6Q58WW2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCAF6Q58WW2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCAF6Q58WW2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCAF6Q58WW2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DCAF6Q58WW2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCAF6Q58WW2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DCAF6Q58WW2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DCAF6Q58WW2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCAF6Q58WW2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCAF6Q58WW2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCAF6Q58WW2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCAF6Q58WW2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DCAF6Q58WW2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
DCAF6Q58WW2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DCAF6Q58WW2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCAF6Q58WW2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCAF6Q58WW2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCAF6Q58WW2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCAF6Q58WW2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCAF6Q58WW2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms