Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CFAP100Q494V2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CFAP100Q494V2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CFAP100Q494V2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CFAP100Q494V2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CFAP100Q494V2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CFAP100Q494V2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CFAP100Q494V2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CFAP100Q494V2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CFAP100Q494V2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CFAP100Q494V2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CFAP100Q494V2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CFAP100Q494V2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CFAP100Q494V2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CFAP100Q494V2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CFAP100Q494V2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CFAP100Q494V2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CFAP100Q494V2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CFAP100Q494V2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CFAP100Q494V2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CFAP100Q494V2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CFAP100Q494V2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CFAP100Q494V2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CFAP100Q494V2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CFAP100Q494V2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CFAP100Q494V2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CFAP100Q494V2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CFAP100Q494V2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CFAP100Q494V2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CFAP100Q494V2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CFAP100Q494V2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CFAP100Q494V2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CFAP100Q494V2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CFAP100Q494V2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CFAP100Q494V2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CFAP100Q494V2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CFAP100Q494V2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CFAP100Q494V2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CFAP100Q494V2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CFAP100Q494V2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CFAP100Q494V2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFAP100Q494V2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFAP100Q494V2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CFAP100Q494V2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CFAP100Q494V2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CFAP100Q494V2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CFAP100Q494V2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CFAP100Q494V2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CFAP100Q494V2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFAP100Q494V2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFAP100Q494V2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFAP100Q494V2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFAP100Q494V2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFAP100Q494V2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CFAP100Q494V2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CFAP100Q494V2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CFAP100Q494V2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CFAP100Q494V2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CFAP100Q494V2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CFAP100Q494V2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CFAP100Q494V2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CFAP100Q494V2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CFAP100Q494V2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CFAP100Q494V2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CFAP100Q494V2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CFAP100Q494V2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CFAP100Q494V2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CFAP100Q494V2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CFAP100Q494V2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CFAP100Q494V2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CFAP100Q494V2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CFAP100Q494V2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CFAP100Q494V2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CFAP100Q494V2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CFAP100Q494V2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CFAP100Q494V2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CFAP100Q494V2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFAP100Q494V2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFAP100Q494V2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFAP100Q494V2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CFAP100Q494V2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFAP100Q494V2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFAP100Q494V2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFAP100Q494V2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFAP100Q494V2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFAP100Q494V2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFAP100Q494V2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFAP100Q494V2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFAP100Q494V2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFAP100Q494V2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFAP100Q494V2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFAP100Q494V2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFAP100Q494V2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFAP100Q494V2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFAP100Q494V2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFAP100Q494V2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFAP100Q494V2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFAP100Q494V2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CFAP100Q494V2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CFAP100Q494V2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms