Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP21-2Q3LI59 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms